مشاكل أخرى متنوعة خاصة بنظام MTS علي منظومة نافذة: 
	- مشاكل الربط مع الجهات الرقابية حيث ينتج عن ذلك المشاكل التالية: 
	
		- عدم تطبيق قرار رئيس الوزراء 3053 في شأن اللجان المشتركة. 
 
		- تأخير العرض على تلك الجهات وقد تصل إلى 4 أيام أو أكثر. 
 
		- المستندات المطلوبة لكل جهة على حدا وعدم الاكتفاء بما تم رفعه من مستندات بمعرفة الموردين. 
 
		- تأخير إصدار المطابقات الخاصة بالرسائل. 
 
		- إلغاء لجان التظلمات السابق العمل بها في ظل القرار الجمهوري 106.